哈尔滨工程大学简称哈工程，是中国著名的军工类大学，起源于哈军工的衣钵，在军工界有很高的声望。其”三海一核“专业（即船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用）更是撑起中国在海洋建设、海军建设等方面的国际地位。成为现在的哈工程的专业建设导向。
南京理工大学简称南理工，源于哈军工的炮兵工程系，分建而来。南京理工大学著名的火炮技术，让中国真正成为火炮技术世界第一的国家。在2018年王泽山院士获得了2017年度国家最高科学技术奖，奖励他在火炮炸药技术方面的贡献。
细细想来，南京理工大学和哈尔滨工程大学本是一家（都源于哈军工），后因建设需要成为两地办学，各自都成长为国内顶尖的军工大学，同属国防七子行列。
哈尔滨工程大学在江苏省的录取分数
南京理工大学在黑龙江省的招生分数
南京理工大学在黑龙江省的招生分数
从分数上来说，两个学校相差不大，哈工程在江苏的分数线在376以上，这个分数在江苏也是有机会上南京理工大学的，同样的南京理工大学在黑龙江省的分数在571以上，同样是有机会上哈尔滨工程大学的，因此在分数线上来说相差不大，两省的比较可以看出！
在2017年的学科评估中，南京理工大学和哈尔滨工程大学一样分别都是一个A+，一个A-，且都是各自最好的专业，哈工程的船舶与海洋工程，南京理工大学的兵器科学与技术专业。一个造船，一个造炮。B以上学科哈工程（包括A类）15个，南理工16个，相差不大，两个学校的学科实力真的比较接近。
在2020年的最新排名中，南京理工大学综合排名全国第45名。哈尔滨工程大学排名全国第53名。
在软科排名中，南京理工大学排名36，哈尔滨工程大学排名56。
在2020年理工类大学排名中，南京理工大学排16，哈尔滨工程大学排名28
武书连2020综合排名
软科排名2020年
理工排名2020
在三大榜单中，南京理工大学的排名均比哈尔滨工程大学要高。这也是目前哈尔滨工程大学比较尴尬的处境。
目前哈尔滨工程大学目前建设有世界一流学科1个：船舶与海洋工程
国家重点一级学科1个：船舶与海洋工程
黑龙江省重点一级学科11个：船舶与海洋工程、动力工程及工程热物理、计算机科学与技术、信息与通信工程、材料科学与工程、核科学与技术、力学、控制科学与工程、机械工程、管理科学与工程、光学工程
南京理工大学目前拥有世界一流学科1个：兵器科学与技术
国家重点学科2个：兵器科学与技术、光学工程
江苏省重点学科：光学工程、机械电子工程、工程热物理、计算机应用技术、通信与信息系统、控制理论与控制工程、纳米材料及相关技术
南京理工大学和哈尔滨工程大学几乎处于同一阶层。目前来看南京理工大学比哈尔滨工程大学略微占据优势，但是差距不大，几乎是伯仲之间，因为同属工信部，学科设置上两个学校相差不大。部分学科用重叠，B级以上学科几乎是一模一样。因此在选择的时候完全根据自己的兴趣选择，在选择顶尖专业的时候，学船舶、控制无疑哈工程，学兵器、化学则选择南理工。
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