子宫内膜异位可能以着床病灶的形式在卵巢表面生长或在侵入卵巢后发育出充血的囊肿，称为子宫内膜瘤或“巧克力囊肿”。之所以称为巧克力囊肿，是因为它们内部的血液将在一段时间后转为暗红褐色。这些囊肿可能小如豌豆，亦或长得大过葡萄柚。
子宫内膜异位可能刺激周围的组织并在内部产生称为粘连的瘢痕组织。粘连可将盆腔器官黏为一体并完全包住，或甚至粘连到附近的肠道。粘连可能会阻止输卵管在卵巢排卵期接收卵子。
子宫内膜异位也可能生长在肠道壁或介于阴道和直肠间的组织中。
高达 10% 的女性可能患上子宫内膜异位。大多患有子宫内膜异位的女性少有或毫无任何症状，一些女性会出现严重的痛经，慢性盆腔痛或性交痛，而在其他患有子宫内膜异位女性身上出现的唯一症状可能就是不孕不育。女性通常在因持续性卵巢囊肿或其他病因接受骨盆手术时才诊断出子宫内膜异位。
子宫内膜异位会影响已生育的妇女，也会发生在青少年及青年女性身上。一些专家认为子宫内膜异位可能更常见于从未怀过孕的女性，24% 至 50% 的不孕不育女性和超过 20% 的有慢性盆腔疼痛的女性可能患有子宫内膜异位。深圳中山泌外试管辅助生育：患有子宫内膜异位的不孕女性是适合做试管婴儿的，不少患者已经通过试管成功怀孕了。