清华大学是我国34所副部级高校之一。所谓“副部级高校”是目前中国最顶尖的国家重点大学，清华大学校长是副部级别领导（副省级）清华大学是国家重点大学，是教育部直属的，校长是副省部级，校长的行政级别是极高的。中国大学分三类,第一类即所谓的国家级重点大学,其中又有三十一所大学是国家确定的副部级高校，这些高校的党委书记和校长为副部长级。
这些高校的校长、书记等高层领导由中央组织部任命而非教育部任命。一般在学校介绍中说“中央直管”，就是副部级大学，也称副部级高等学校（简称“副部级高校”）、中央直管高校等。另外，清华大学领导级别：副部级：党委书记、校长正局级：党委常务副书记、常务副校长副局级：党委副书记、常委、副校长、教育长、总务长、秘书长。正处级：各学院的分党委书记和院长，党委行政直属部门正职，教辅单位书记、主任。
2、目前全国有31所大学是副部级即：北京大学、清华大学、中国人民大学、北京理工大学、北京航空航天大学、北京师范大学、中国农业大学、哈尔滨工业大学、复旦大学、上海交通大学、中国科学技术大学、西安交通大学、西北工业大学；浙江大学、南开大学、天津大学、南京大学、武汉大学、四川大学、中山大学；吉林大学、厦门大学、大连理工大学、山东大学、同济大学、华中科技大学、东南大学、中南大学、重庆大学、兰州大学、西北农林科技大学。另外，国防科大是副大军区级（相当于副部级）。
