首先，排除南大。南大与这些学校基本是同一档次的学校，去南大最差的专业太亏，没必要。
专业很重要！专业很重要！专业很重要！记得有一个清华的学生在知乎中发过一篇长文，痛说自己当初为了虚荣心去了清华冷门专业而没有去复旦或人大热门专业的错误决定。他毕业以后去了一个清水衙门的事业单位，收入微薄，在京买房成不可能实现的梦。而当初比他分低的同学因为学了金融专业，收入与他根本不在一个层面上。这个学生还是为了清北光环，而南大与北航、同济本身也没有什么太大的优势可言，所以，必须先排除南大。
第二，去掉西安交大。主要是考虑就业，西安不如北京和上海。西安交大毕业的学生毕业后多数不会留在西安工作，因为西安的就业机会少，待遇也比较低。西安交大毕业的学生多数会到深圳或广州等南方城市发展，去北京、上海的很少，因为北京上海当地名校就很多，不缺优秀毕业生。不能在上学的城市工作其实也是一个缺点，不熟悉、同学少、不适应等都会带来一些困扰。
再者，西安交大的录取分数一般比北航和同济低一些，在山东能低10分左右，去的话亏分太多。
北航和同济这两个学校几乎是同分的，可能南方同济稍高，北方北航稍高。这两个学校就很好选了，将来愿意在北京工作，选北航；将来愿意留上海工作，选同济。愿意学建筑学、土木工程、汽车工程、城市规划之类的选同济；愿意学计算机、软件工程、材料、电子信息、自动化、航空航天什么的，选北航，比较而言，北航的热门专业更多一些。
尖子班之类的不太推荐。为什么呢？学好了什么都好说，但别忘了，这些学校的学生都是学霸，谁都不敢保证自己能学到前头。我儿子当年的成绩可能与你儿子差不多，山东省400多名，比浙大分数线高4分，比南大高6分，比北航高8分，去了北航计算机。他的高中同学比他高2分，被北航40人的尖子班录取，前两年进行通识教育，两年以后选专业。他同学想学计算机，但因为名次不靠前选不到，只能被迫去了飞行器设计专业，自己也很懊恼。现在看来，还不如开始就不去尖子班，选择自己喜欢的专业稳稳当当地一路学下去，岂不更好？
总之，我认为你儿子的情况比较好选择，根据城市和专业在北航和同济之间选就是了。
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