外观区别
首先，从外观方面来看，大鳄龟和小鳄龟的差异是比较明显的。首先是突刺，二者的背甲上都是有突刺的，不过大鳄龟的突刺看起来比较明显，而小鳄龟的突刺不太明显，有时候甚至观察不到。再就是它们的头部，大鳄龟的头部看起来比较尖，小鳄龟的头部则是比较圆的。还有它们的尾巴，大鳄龟的尾巴比小鳄龟的要长一些。
性格区别
二者的性格方面也是有差异的。大鳄龟的胆子比较小，很容易受惊，一旦有陌生人接近它们会很有敌意;小鳄龟的胆子则比较大。
进食区别
在进食的时候，它们的活性也是有差异的。大鳄龟进食的时候会一直在原地不动，小鳄龟在进食的时候比较主动，会积极抢食。
价格区别
大鳄龟和小鳄龟的价格也是不同的。虽然不同地方的具体价格是不同的，不过总体来看大鳄龟的价格都比小鳄龟的要高一些。