本病病因，目前比较一致的认识是，与湿邪热毒侵及，恣食生冷肥甘之品及郁怒思虑，情志不遂等有关。其病机如下：
湿热内蕴：因感受湿邪热毒，蓄积大肠；或饮食不节，壅滞肠胃，郁久则热毒壅盛，湿热互相搏结，伤及气血，化为脓血而下泄。
气滞血瘀：多系情怀不畅，郁怒伤肝，气滞血涩，饮食难化，日久胶结。
脾胃虚弱：久痢不愈，必使脾胃受损，亦可因禀赋不足，脾胃素虚，感受寒湿或饮食生冷，伤及脾脏阳气，病程过久，继而损伤及肾而发病。
本病初起，多以湿热壅滞肠胃为主，病情进一步发展则可致气滞血瘀，最后则出现脾肾两亏乃至阴阳俱虚之证候。