局部检查发现肛管后正中或前正中部位的肛裂“三联征”（肛裂、前哨痔、肛乳头肥大），则诊断明确。急性肛裂可见裂口边缘整齐，创面浅，呈红色并有弹性，无瘢痕形成。慢性肛裂因反复发作，边缘变硬纤维化，创面深而不整齐，肉芽灰白。裂口下端皮肤因炎症、水肿及静脉、淋巴回流受阻，形成袋状皮垂向下突出于肛门外，称“前哨痔”。裂口上端的肛门瓣和肛乳头水肿，形成肥大乳头。
一般肛裂患者不宜做直肠指诊及肛门镜检查，以免引起剧烈疼痛。特殊情况下可作下列检查：
1、直肠指诊及内镜检查
对难以确诊的肛裂可酌情进行直肠指诊及肛门镜检查，操作时应动作轻柔，以免引起患者剧痛。
2、组织病理学检查