按肠梗阻发生的基本原因可以分为三类：
机械性肠梗阻：由肠腔内的堵塞或由肠外部病变对肠的压迫、牵拉引起。肠腔内的堵塞因素常见的有蛔虫团、肿瘤、胎粪、异物及小肠先天性狭窄或闭锁。造成梗阻的肠外因素有腹膜炎后引起的肠管粘连或肠管浆膜间的纤维带形成、肠疝时疝囊内肠管的扭转或套叠，腹腔内肿瘤的压迫等。
动力性肠梗阻 发病较上类为少，是由于神经反射或毒素刺激引起肠壁肌功能紊乱，使肠蠕动丧失或肠管痉挛，以致肠内容物不能正常运行，但无器质性的肠腔狭窄。常见的如急性弥漫性腹膜炎、腹部大手术、腹膜后血肿或感染引起的麻痹性肠梗阻。痉挛性肠梗阻甚少见，可见于如肠道功能紊乱和慢性铅中毒引肠痉挛。
血运性肠梗阻：较少见。是由于肠系膜血管栓塞或血栓形成，使肠管血运障碍、继而发生肠麻痹而使肠内容物不能运行。
肠梗阻又可按肠壁有封锁血运障碍，分为单纯性和绞窄性二类，前者只是肠内容物通过受阻，而无肠管血运障碍；后者系指梗阻并伴有肠壁血运障碍者，可因肠系膜血管受压、血栓形成或栓塞等引起。