直肠息肉分类均按组织学表现和病理性质划分。
①新生物：计有管状腺瘤、管状绒毛腺瘤、绒毛腺瘤和家族性腺瘤息肉病。这类息肉是由肠上皮生长的新生物， 极易发生癌变。
②错构瘤：这类肿瘤是正常组织的异常混合， 一种或数种组织过度生长的肿瘤。包括：幼年息肉、幼年息肉病、黑斑息肉和黑斑息肉综合征。息肉一般不会恶变， 但息肉病则多会恶变。
③炎性息肉：即假息肉， 由肠粘膜溃疡而引起。常见的有：慢性溃疡性结肠炎、良性淋巴样息肉和良性淋巴样息肉病， 属正常淋巴组织， 与癌变无关。
④增生性息肉：又叫化生性息肉。是在直肠和结肠粘膜上的无蒂小结节， 可单个孤立， 也可多发， 颜色与周围粘膜相同， 直径仅有几毫米， 一般无症状， 多并发腺瘤。
⑤综合征类：该类病在肠胃内有息肉， 在胃肠道外有特殊表现。