中医认为本病的形成系胎中蕴热蕴毒或饮食失调，脾失健运，内蕴湿热，外受风湿热邪而致。胎毒与风湿热邪相合，搏于肌肤则起红斑、丘疹、水疱；热盛肉腐则见糜烂，流液；风盛则瘙痒不休；热扰神明则烦躁，寐不安。
西医目前尚未完全清楚本病病因，一般认为本病的发病机制与遗传、免疫和对生理药理介质反应异常有关。约70％患者有家族遗传过敏史。AD患者发生鱼鳞病、斑秃、白癜风等病比普通人多。本病与过敏性疾病的关系密切， 患者本人及其家族成员往往曾患异位性皮炎、哮喘、过敏性鼻炎、过敏性结膜炎、荨麻疹、血管性水肿等变态反应性疾病，并伴有某些血清学异常（IgE抗体增高）和血液学异常（嗜酸性粒细胞增多）。本病儿童常对某些食物过敏，易致敏的食物有蛋、牛奶、鱼、虾类，也有对果品、芒果等过敏的。免疫异常主要表现为因遗传素质而过量形成IgE，以及迟发型细胞过敏反应的减弱。患者白细胞和表皮细胞对β肾上腺素能性激动剂的反应迟钝，所产生的cAMP水平及抑制 表皮细胞的核分裂功能降低，β肾上腺素能受体与β兴奋剂亲和力下降，肾上腺素能受体比率增高等。此外，尚发现单一核细胞内cAMP一磷酸二酯酶（ PDE）活性增高，使cAMP水平下降。 同时AD患者可能存在必需脂肪酸（EFA）代谢异常。