非手术疗法处理色素痣最大的优点是痛苦小，对浅表、细小、非恶性色素痣效果不错，有时不留下痕迹。但是，也有其自身明显的不足：如不能对病变组织进行病理组织切片分析以明确病变的性质是良性还是恶性。其次，对较大范围的病变；对处治病变的彻底性；及术后外观常不及手术疗法好。当然适应范围也就有限。
手术疗法最大的优点是能将病变组织包括转移的淋巴结一并彻底切除。同时，经过病理组织检查，还能准确了解病变性质。对任何类型、任何部位的色素痣均可较好地进行处理。当然亦有美中不足之处，如需一定条件，具有一定的技术性及具有确保手术成功的一切设施与手段，还要忍受一定痛苦，遇上疤痕体质病人还会出现明显的疤痕。