正常情况下，扁桃体的淋巴细胞和抗体能将病菌消灭或控制住，维持机体的健康。但是，任何防御的力量都是有限的，当身体抵抗力下降，如在寒冷或潮湿环境、身体过度疲劳、营养不良、缺乏锻炼等情况下，扁桃体的防御能力便会减弱。或者当病菌多次侵袭，特别是病菌数量大、毒力强时，扁桃体会因寡不敌众而被病菌攻破占领，发生炎症，出现红肿、疼痛、化脓。轻者低热、咳嗽，喉部不适；重者高烧不退、呼吸急促，甚至高热惊厥。
若治疗不及时，人体抵抗力不足以战胜病原体时，炎症就可向周围组织扩散，并可经血液播散至其他器官，使之发生炎症，还会引起宝宝全身性的病理反应，如继发风湿热、风湿性关节炎、风湿性心脏病、急性肾炎和无显着原因的低热。当然，像扁桃体周围脓肿、急性中耳炎、副鼻窦炎等并发症也时有发生。此时，扁桃体便成了宝宝生病的“罪魁祸首”。