由于口、咽、鼻腔及鼻窦的感染，引起咽后淋巴结炎，进而化脓，脓液蓄积在口咽后方咽后隙的一侧。此外，咽后壁损伤（异物或其他外伤）后感染、或邻近组织炎症扩散进入咽后隙，也可发生咽后脓肿。
1、急性型 最常见为咽后淋巴结化脓，发生于3岁以下幼儿。由于口、咽、鼻腔及鼻窦的感染，引起咽后淋巴结炎，进而化脓，脓液蓄积在口咽后方咽后隙的一侧。此外，咽后壁损伤（异物或其他外伤）后感染、或邻近组织炎症扩散进入咽后隙，也可发生咽后脓肿。致病菌与扁桃体周脓肿相似。
2、慢性型 多由颈椎结核引起。
病理
1、咽后淋巴结感染：口腔、咽、鼻及某些急性传染病引起咽后隙淋巴结炎，进而化脓形成脓肿。
2、咽后间隙外伤、异物致咽后间隙蜂窝织炎，形成脓肿。
3、颈椎结核时脓液蓄积于颈椎与椎前筋膜之间，向前穿破椎前筋膜进入咽后间隙而形成结核性咽后脓肿，称冷脓肿。亦有因颈淋巴结核致咽后结核脓肿者，多见于成人。