主要由于下颌骨发育不良，第三磨牙萌出时缺少足够的位置，不能正常完全萌出，牙冠仅能部分萌出或牙冠位置偏斜，少数牙完全埋伏在骨内。临床上以垂直位软组织阻生的下颌第三磨牙冠周炎最多，究其原因是牙冠远中部分被龈组织覆盖，其间构成较深的盲袋，食物残渣进入盲袋后不易清洗排除。龈瓣盲袋中的温度与湿度利于细菌生长繁殖，当冠周软组织与龈瓣受到牙齿萌出时的压力，造成局部血运差，及咀嚼食物时遭到对侧牙的咬伤，细菌即可侵入。在机体抵抗力强时，局部症状不明显，但因工作疲劳、睡眠不足、月经期、分娩后或感冒等，全身抵抗力下降时，冠周炎可急性发作。