干燥综合症是一种结缔组织疾病，由于疾病的发生对人体的危害非常大，所以及时的诊断干燥综合症可以帮助患者更好的治疗疾病，但是患者在做诊断时，一定要与以下疾病区分，以免引起误诊。
1、系统性红斑狼疮：虽然两者均为自身免疫性风湿病，抗核抗体、抗RNP抗体、抗SSA抗体和抗SSB抗体阳性，但通过检查抗dsDNA抗体、抗Sm抗体及临床表现不难鉴别。应注意60%的病人两病重叠。
2、类风湿关节炎：两病的共同特点是均可出现类风湿因子阳性，类风湿关节炎的关节病变是一种侵蚀性关节炎，与SS鉴别较易，但应注意有60%～70%类风湿关节炎病人与SS重叠。
3、肾小管酸中毒：对于不明原因的肾小管酸中毒，应高度警惕干燥综合症继发的可能。
4、流行性腮腺炎：多见于儿童，呈流行性，与感染源接触经2～3周潜伏期才发病，病情不反复。症状在1周左右减轻，有时也可伴有关节炎，关节炎也可在数周内减轻。
5、化脓性腮腺炎：多见于成人及糖尿病患者，在机体抵抗力下降时发病，大部分为一侧性，有发热、白细胞增加及局部明显的炎症表现。