一、三叉神经痛的病因
目前研究角度来说，三叉神经痛病因不明，但目前提出几种学说可能与三叉神经痛有关。
1、短路学说：认为神经髓鞘崩解可能引起相邻两纤维之间发生“短路”，轻微的触觉刺激即可通过“短路”传入中枢，而中枢传出冲动也可再通过“短路”成为传出冲动，达到痛觉神经元的阈值而引起疼痛。
2、脱髓鞘学说：三叉神经感觉根或半月节或三叉神经周围支受到压迫或损害发生脱髓鞘性变；如解剖结构异常，血管畸形、骨孔压骨膜炎症、动脉硬化等。部分神经髓鞘脱离使原来神经束的抑制作用减弱或消失，增加了三叉神经背核反向的自我激发及重复发放，使受损的神经变得敏感，产生疼痛。
3、脑血管微型障碍：认为三叉神经痛与脑血管及脑组织畸形有关。
4、脑干三叉神经束核和感觉核的异常兴奋性放电也可能为引起三叉神经痛的原因。
5、极少部分由颅内肿瘤压迫三叉神经引起疼痛，见于继发性三叉神经痛（即症状性三叉神经痛），尤其以青年患者多见。
6、毒感染学说如带状疱疹易累及三叉神经第一支引起疼痛。
7、其它：遗传学说、颈神经学说、变态反应学说等等。
二、三叉神经痛的病理
三叉神经感觉根切断术活检发现神经节细胞消失，神经纤维脱髓鞘或髓鞘增厚，轴索变细或消失。部分患者可发现颅后窝异常小血管团压迫三叉神经根或延髓外侧。