祖国医学认为，三叉神经痛属“头痛”、“偏头痛”、“面痛”等范畴。古医书中有“首风”、“脑风”、“头风”等名称记载，如《素问．风论》：“首风之状，头面多汗恶风，当先风1日则病甚，头痛不可以出内。”有些三叉神经痛患者，经服用中药后可收到一定的治疗效果，可使疼痛发作停止或减轻。有的临床医师采用内服中药治疗三叉神经痛，取得了一定的效果。中医对于本病主张辨证施治，根据不同的类型，给与针对性的治疗。
对于风邪外袭型，主张治宜活血化瘀，祛风止痛。可采用加味吴茱萸汤（党参、川芎各25g，吴茱萸、白芷、天麻各18g，干姜、薄荷、防风各12g，丹参、香附各20g，赤芍15g，钩藤30g，细辛3g），或可采用白附子10g，僵蚕10g，天麻10g，防风10g，白芷10g，细辛10g，胆南星10g，地龙10g，川芎10g，全蝎3g。
对于肝火上炎型，采用滋阴潜阳，降火熄风。可采用全蝎5g，蜈蚣2条，僵蚕、地龙、川芎、牛膝、生地、白芍、白术各15g，制川乌10g，白芷、天麻、制半夏各10g，细辛4g，钩藤20g，石决明30g（先煎）。也可采用白僵蚕、蔓荆子、炒没药、龙胆草、白蒺藜各9g，白芷12g，白芍、生地黄各15g，石决明（先煎）30g，全蝎6g，甘草3g。