阴茎癌并不少见，在男性肿瘤发病率中占有相当比例，阴茎癌的发病率，由于国家、地区、民族、宗族、卫生习惯等因素，很不一致。一般欧美国家发病率较低，亚洲、非洲、拉丁美洲各国发病率较高，而犹太民族及信奉伊斯兰教的穆斯林国家，发病率很低。
1、使用避孕套：虽然没有100%的预防效果，但使用避孕套在预防和治疗性传播性疾病的作用是极为明显。一项相关的临床研究正在进行中，在此试验中性伴侣间随机给予避孕套，发现避孕套使用组HPV相关性生殖器病变的治愈时间明显缩短。
2、戒烟：虽然吸烟在阴茎癌发病过程中的具体作用还不清楚，但吸烟作为阴茎癌的危险因素之一是毫无疑问的。吸烟者比不吸烟者患阴茎癌的可能性高出很多，因此，积极开展戒烟运动是预防阴茎癌的措施之一。
3、其它：其它预防措施包括预防包茎、治疗生殖器慢性炎症性疾病、提高卫生等。