阴茎癌在临床上表现的症状不是很明显，所以很容易被混淆，相关专家对于阴茎癌一定要鉴别，通常诊断阴茎癌，一般多无困难。如阴茎癌已经溃破，基底部硬实，肿瘤呈菜花状外翻，分泌物多有恶臭。阴茎癌当病变仅有硬结尚未破溃，如有包皮覆盖，则应行包皮环切将病变部位暴露，局部活组织病理检查，可明确诊断。
阴茎头部硬结病须与早期阴茎癌相鉴别
1、阴茎乳头状瘤发病部位与阴茎癌相同，肿瘤有蒂或无蒂，边界清楚，表面红色或淡红色，质软，亦可形成溃疡，感染后出血，生长缓慢，常不易与阴茎癌区别，必须靠活体组织检查才能确定。应该注意，乳头状瘤可在局部发生恶变。
2、阴茎白斑病变呈白色，大小不等，边界清楚，质硬，易发生在、龟头及尿道口的粘膜处。阴茎白斑可以恶变。
3、阴茎增殖性红斑较少见，常发生于龟头，呈深红色的圆形斑病变，边界清楚，单发或多发，中心部呈乳头状，脱鳞状屑，可发生溃疡，也认为是一种癌前病变。
4、多见于龟头及冠状沟、包皮内板，病变多为小乳头状突起物，亦可突起呈菜花状、乳头状、色紫红，散在，堆积，数目多少不定，亦可糜烂，须经病理证实，现认为是，与病毒感染有关。
5、阴茎结核发生在龟头。初起为小脓疮，溃破后形成溃疡，周围较硬，基底为肉芽组织，可向深部侵犯，破坏龟头，应依靠病理检查区别。
6、下疳发生冠状沟、龟头。初超粟米大丘疹或硬结，四周肿胀，亮如水晶，破后面溃疡，色呈紫红，无脓水，四周坚硬凸起，形如缸口，中间凹陷，基底平坦清洁，属性传播疾病。