持续发展原则：使用的肥料对环境没有不良影响，还可起到保护环境的作用。安全优质原则：施加肥料对作物的营养、品质、味道且植物的抗性不会产生不良的后果。化肥减控原则：施加的物价氮素量不可超过作物需求量的一半。有机为主：以农家肥料、微生物肥料、有机肥料为主，化学肥料为辅。
一、持续发展原则
绿色食品指的是无污染、营养全面、优质的食品，合理施加肥料、农药等才可生产出绿色的食品，才可保证食品的品质。绿色食品使用的肥料对环境没有不良影响，还可起到保护环境的作用，可保持、提高土壤肥力，提高土壤的活性。
二、安全优质原则
绿色食品在生产中要用安全且优质的肥料，这样才可生产安全且优质的绿色食品。合理施加肥料对作物的营养、品质、味道且植物的抗性不会产生不良的后果。肥料要选AA级绿色食品生产可用的肥料种类，不要使用化学合成的肥料。
三、化肥减控原则
在保证植物营养有效供应的基础上最好减少化肥的施加量，还要注意各种微量元素的比例平衡。施加的物价氮素量不可超过作物需求量的一半。另外，要注意化肥的选择，不可施加法律法规规定不能使用的肥料。
四、有机为主原则
绿色食品在生产过程中要以农家肥料、微生物肥料、有机肥料为主，化学肥料为辅，严格控制化学肥料。注意，施加有机肥的时候必须腐熟的有机肥，不可施加生肥，否则容易产生肥害。