韭菜发生根腐病，是由于在气温较高多阴雨的环境下，土壤表面存在没有及时排掉的积水，导致湿度增加，使根系的呼吸难度，从而导致根部腐烂。韭菜底根腐病的治理需要在梅雨季到来之前进行。要先停止给植株浇水，等叶片的尖端出现轻微的干黄时再进行浇水。下完雨要及时排水。如发现病株，可以每7天用1次波氮尔多液灌根治疗。
一、韭菜根腐病的防治方法
对韭菜水分管理时避免在雨季到来前浇水，适当的进行蹲苗可以使韭菜的自身的抵抗能力提高。在降雨之后及时地进行排出操作，降低土壤湿度，避免产生涝害。在韭菜收获后，清除土壤中残留的植株残体，避免病菌扩散。在后续种植中进行合理倒茬。在冬季到来前要及时进行覆土。
种植时合理控制种植密度，保证植株间有一定的通风透光率。要给予少量多次平衡施肥，避免氮肥重施偏施。生长期间进行叶面肥的补充，使植株生长的叶片完整、色彩鲜嫩、生长茂盛。如发现病株，进行化学防治，使用波尔多液7天1次进行灌根。
二、割韭菜的次数
韭菜每年的收割次数一般根据长势而定，土壤的水分、养分的含量，都会影响次数。一般情况春季可进行3-4次收割。夏季韭菜生长品质不高，可以采用遮阴手段，保证植株正常生长，通常只收获韭菜花。等到秋天气候凉爽，可收割2-3次。处于冬季若要生产韭黄，可减少收割次数。