一般来说，边境牧羊犬的体味都源于耳朵、口腔还有肛门腺。边牧犬的耳朵贴在脑门的两侧，有着丰富浓密的毛发覆盖，特别容易滋生螨虫等细菌，而耳道内潮湿也容易沉积污垢。在感染耳螨病后就容易散发出难闻的异味，使得边牧犬产生体味。
此外，长时间不清晰口腔，时期食物残渣在口腔中腐烂滋生细菌，导致口臭、牙龈炎、牙周炎而散发出难闻的异味，使得边境牧羊犬身体产生浓重的体味;同时，肛门腺也是同时沉积污垢散发异味的部位，要是长时间不清理，都容易导致边牧犬身体产生怪味。
当发现边境犬的气味时，主人应首先查明原因，然后有针对性地处理。另外，在日常生活中，主人应该做好预防味觉的工作。及时、定期清洗犬体，清洁耳朵，每周刷牙3-4次，保持口腔清洁健康。同时，要及时清洗犬的肛门腺，保持身体清洁，防止异味的发生。