惩罚是制止萨摩耶的不良的行为的有效手段，在使用此手段时，训练者必须态度严肃，语调高亢而尖锐。严厉的惩罚还有指着犬叱骂，用石块、书本向犬的身边猛掷，用鞭棍责打，当然，不是真刀真枪地责打，主要目的还是给犬以威胁的姿态，经过对其神经的紧张刺激，使它记住这次教训，下不为例。
如狗狗趁主人不注意，偷偷溜进厨房，把放在那里的食物吃个精光，对狗狗这类行为要坚决惩办，绝不姑息，能够把犬重新引至厨房食物的地方，对着它高声呵责、横眉怒目，并把棍子举起做欲打状，使其对此地及偷食行为产生恐惧，不再重蹈覆辙。
如果你的狗对排泄物上瘾，它必须受到严厉的惩罚才能停止它的坏习惯。直接的惩罚是把粪便和其他脏物放在狗面前。当狗吃东西的时候，它会大声喊叫和责骂，把脏东西带走。一两天后，它将以同样的方式进行测试，直到狗不再吃东西。如果一些狗在他们面前摆姿势，但他们的习惯在他们后面保持不变，可以采取间接惩罚来拾起一两块石头，然后秘密地跟随他们。当他们发现狗要碰脏东西时，就猛烈地把它扔出去。在恐惧中，狗认为这是他的行为的结果。重复几次，狗就会克服这种恶毒的怪癖。
当然还有别的办法，即在主人离去前，往犬所嗜食的秽物上撤些辣椒粉等强刺激又无害的物品，犬食后辣得难熬，自作自受，以后便有了记性，再也不敢去吃了。另外，有些犬喜欢撕扯拖鞋、玩具、毛巾等物，一经发现，应毫不留情地给予惩罚。若屡教不改，积沿成习，更要给它一两次痛彻骨髓的教训，否则，它就不会轻易觉醒。