在素食和肉食的选择中，边境牧羊犬是不折不扣的食肉动物，但在野外生活的时候，它们偶尔也会吃些青草和果实等植物。而在主人的调教下，家养的宠物狗与野外生活的狗狗，两者之间的饮食习惯还是存在很大的差别。家长能够经过从小的培养和训练，使边牧犬拥有更为合理，更能让人接受的饮食习惯。
要训练边境牧羊犬的饮食习惯一定得从幼年开始，在狗狗成功断奶之后就要着手训练。在正式训练之前，主人应当为边牧犬选择一套合理的饮食方案，制定健康科学的饮食计划，然后按部就班的培养训练，从长期的饲养和训练中，让边牧犬养成健康的饮食习惯。
家养宠物狗，主人一般会选择专业的狗食、新鲜蔬菜、罐头狗、狗饼干等食物进行饲养。另外，在业余时间，可以选择一些瘦肉、牛肉、羊肉等脂肪含量较低的食物，加工后喂给边境犬。为了平衡边境牧羊犬食物的营养，满足其生长发育的营养需要，许多父母会选择更多的食物，然后进行合理搭配，并每天定期定量地进行饲养。在培养狗良好的饮食习惯的同时，也能保证边境犬的健康成长。
此外，训练边境牧羊犬拥有良好的饮食习惯，除了选择健康合理的食物饲养之前。家长还应当每天定时、定量、定点的饲养，别随便完全的给它更换食物。而每次需要更换食物的时候，都需要按部就班，在7-10天的时间左右完成食物更换，让边牧犬有足够的时间去适应新的食物，防止造成肠胃消化负担，危害到边境牧羊犬的身体健康。