导致边境牧羊犬换毛的原因有许多，真菌性皮肤病，细菌性皮肤病，正常的生理性脱毛，内分泌失调等等。一般来说，正常的生理性脱毛在幼犬3、4月龄就会出现1次，以后在每一年的春秋季节变化的时候，边牧犬也会出现换毛的情况。而在狗狗的换毛期间，主人应当特别注意，小心养护。
在幼犬3、4月龄的时候它们会脱去身体上的胎毛，逐渐生长出成年的毛发，而这也是它们迈上成熟期的一个重要标志。我们知道，狗狗的成长需要很多的能量，保持身体的健康需要全面的营养补给。同样，要让宠物狗皮毛健康光泽，主人需要注重蛋白质、维生素、矿物质、钙质等营养的补给，并且需要保持营养的全面丰富，为新毛发的生长提供能量。
在每年换毛期间，主人应适当增加梳子的数量。每天两次，梳理犬全身，促进血液循环，加强新陈代谢，清除毛发上的污垢和灰尘，清理掉掉掉下来仍留在犬身上的毛发，为新毛发的生长提供足够的空间，使新毛发更加光滑健康。
在边境牧羊犬换毛期间，主人应当尽可能少带狗狗外出，特别是要禁止狗狗外出钻寻草丛，防止感染虱子、跳蚤等寄生虫。同时，也杜绝传染疾病的发生。让边境牧羊犬能够顺利健康的度过换毛期。