外生殖器检查可以由专家进行，人们也可以进行自我检查，以帮助早期发现某些疾病，这主要包括以下五个方面。
(1)注意阴毛的分布有无外生殖器畸形（如尿道下裂、隐睾等），如果有畸形需要进一步检查其体态，毛发分布，乳腺发育。
(2)阴茎的发育，如包皮过长、包茎或嵌顿，阴茎的发育是否与年龄相符，尿道开口有无异位(尿道上裂或尿道下裂)，尿道口是否有炎症、粘连、狭窄或囊肿。
(3)阴茎海绵体情况有无触痛或硬结，阴茎头部有无丘疹、疣或溃疡等病变，有无炎症，疤痕或新生物。
(4)阴囊内容物检查首先注意阴囊的大小、形状，有无慢性瘘管或皮肤粘连，如有阴囊肿大，是一侧还是两侧，阴囊皮肤有无急性炎症改变。
对于阴囊肿块，应该清楚它是来自阴囊还是腹腔。它可以通过站立和躺下来位体检查区分。例如，阴囊肿块是由腹股沟疝、交通性鞘膜积液或精索静脉曲张引起的。躺下时，质量通常肿块消失或缩小。站立时，手指按压腹股沟管的外环，肿块不再出现。移开手指后，肿块重新降入阴囊内；其次，触诊肿块的硬度，是否有波动感或牢固感，以及触诊腹股沟管外环是否有咳嗽冲击感和回复性改变。仔细区分阴囊肿块与睾丸、附睾和精索的关系。透光测试应该按常规进行。睾丸鞘膜积液的透光试验为阳性，但如果鞘膜增厚或鞘膜积液混浊，则不能透光。在阴囊外伤患者中，阴囊内的肿块通常常为鞘膜积血，触之肿块弹性大，阴囊皮肤有瘀斑，透光试验阴性。睾丸检查应注意其大小、形状、硬度、重量，以及是否感觉异常。早期睾丸肿瘤的形状仍像睾丸，并继续发展肿瘤体积增大成圆形。表面光滑坚硬，托起睾丸有沉重感，透光试验阴性，这是睾丸肿瘤的特征。如果病史和体征与肿瘤一致，应注意腹部是否有肿块，并知道腹主动脉附近是否有转移。
在附睾检查中，应注意确定病变位置、附睾头、体和尾部的大小和硬度、结节和触痛的存在、脓肿或阴囊瘘的存在以及输精管有无增粗或结节。
检查精索，看看是否有精索肿块或精索静脉曲张。注意输精管的厚度，是否有结节或压痛，从而消除输精管的慢性炎症或结核。精索肿瘤较为常见，尤其是良性肿瘤，如脂肪瘤，而恶性精索肿瘤多为肉瘤，可在阴囊内触及质硬之肿块。
(5)腹股沟淋巴结大小，软硬度及是否活动，有无慢性溃疡或疤痕。