根管治疗并没有真正改善口腔环境，这也是引起蛀牙等牙病的根源。所以做完根管治疗一定要特别注意这方面的保健，保持口腔环境的配套平衡。否则容易引起进一步的病变，感染等这也是这种治疗的弊端了。
而很大的副作用***在根管治疗的过程中要在牙齿上钻一个洞，暴露感染的牙髓和根管，另外还要将一部分感染的根管壁组织磨除。这两点都对牙齿未来抵抗咬合力量造成负面的影响。
1、任何原因，包括龋齿、隐裂、冠折、畸形中央尖、过度磨耗、牙周病逆行性感染、意外穿髓引起的牙髓炎及牙髓坏死不能保留活髓的情况。
2、任何原因，包括牙髓炎继续发展、干尸塑化治疗失败、牙周炎逆行感染，引起的根尖病变。
3、物理的化学的原因引起的牙髓的根尖的感染，如：充填后垫底不佳温度引起的牙髓刺激，不同金属的电流刺激，牙髓治疗过程中药物引起的根尖炎。
4、不明原因引起的牙髓的退行性改变，如根管内吸收，髓石引起牙髓的病理变化.
根管治疗的并发症有哪些?
1、急性炎症反应，即有急性的疼痛和肿胀。
根管治疗期间急症(EIAE)，是根管治疗术常见的并发症之一。其发生率约为25%~40%，且随年龄的增长而增高，但在现在，随技术的提高已逐渐减少。
2、髓腔侧壁与髓室底穿孔及根管壁侧穿。
髓腔壁穿孔可分为病理性和医源性两种。无论何种原因导致的大范围穿孔，都可导致患牙的拔除，故操作中应特别注意。
3、器械折断在根管中。
牙体组织大多是钙化的硬组织，根管治疗器械是金属的，治疗中是硬碰硬的情况，再加上根管系统的解剖结构十分复杂，器械折断的情况在根管治疗中是无法完全避免的。
4、牙折。
牙折分为冠折，根折和冠根折3种。根管治疗后，由于牙折导致拔除者屡见，故应引起足够重视。
5、根充物超充
根充物超充是根管治疗中常见的并发症，对于某些根尖孔被破坏的患牙来说，根充物超充有时甚至是不可避免的。超充的根充物分为根充糊剂和牙胶两种。
1、是减轻病痛，防止痛感的蔓延
已经有牙髓炎的牙齿会继续恶化，终至牙髓坏死，甚至牙根尖周围病变，这个过程是相当痛苦，而根管治疗不但可以减轻患者的病痛，并可缩短整个病程预防疾病的恶化。
2、是尽可能保持牙齿避免拔除
根管治疗的目的，是在保存齿髓或牙根尖周围组织，使已被侵犯的牙齿仍能以一种良好的健康状态处于它的支持组织中，避免拔除或继续恶化至崩毁的命运。
3、是消灭病灶的传染，重建患牙的健康
根管治疗不但可以扑灭根管内的病菌及其分解物和毒素，并可以治疗牙根尖周围组织的创伤，促使牙根周围组织的修补及愈合
以上荷马口腔主要介绍了根管治疗的危害、适应症、并发症、以及原因。根管治疗主要为了减轻疼痛、保护牙齿被拔除、防止病菌传染。很大的危害***磨牙暴露牙髓，容易引发炎症。根管治疗的并发症很多，所以，治疗后要保持口腔卫生，养成良好的口腔习惯，定期检查。