许多宝石颜色差不多，人们在购买的时候非常容易搞混。不一样的宝石其价值大不相同，而天然祖母绿就是其中价值较高的存在。我们在选购天然祖母绿宝石的时候，必须要特别注意和别的宝石差别开，不然非常容易购到天然祖母绿的替代品，那样损失就挺大了。
市场上，天然祖母绿的仿制品主要是天然绿色宝石和人造仿制品。前者主要有萤石、绿碧玺、磷灰石、翡翠、绿色蓝宝石和含铬钒钙铝榴石；后者主要有合成祖母绿、钇铝榴石和绿色玻璃等。天然祖母绿的折光率为1.564-1.602，硬度为7.5，密度为2.63-2.90 克/立方厘米。利用这些数据，我们就可以区分它们。
萤石拥有微带蓝的翠绿色，其摩氏硬度低，为4，密度为3.18 克/立方厘米，萤光呈淡蓝色；绿碧玺是蓝色碧玺处理后改成绿色，它的二色性显著，双折射率高，为0.18，密度大；磷灰石的颜色为淡绿色略带有蓝的色彩，硬度较小，为5，折光率很大，为1.632-1.667，在紫外光下发磷光；翡翠具备纤维交错构造，有偏细的纤维，这是天然祖母绿所没有的。含铬钒钙铝榴石的颜色为浅绿色，有较强的亚金刚光泽。
天然祖母绿与钇铝榴石以及绿色玻璃的区别主要有两点：一是天然祖母绿大多数会有杂质及裂痕，而钇铝榴石和绿色玻璃则大多数净度较高，部分的内部会有汽泡；二是天然祖母绿有二色性，而玻璃和钇铝榴石只有单一颜色。
合成祖母绿折光率通常低于1.57，密度为 2.63－2.66克/立方厘米，但也有例外的情况。水热法合成的祖母绿，宝石内部会有呈云雾状的包裹体;助熔剂法合成的天然祖母绿，其包裹体呈面包屑状。 合成祖母绿在紫外光下会发强红色萤光，而天然祖母绿不发光或发暗红色荧光。值得一提的是，由于合成祖母绿的技术已经十分发达，以上方法并不能保证100%区分天然品与合成品。最保险的方法就是前往正规有信用的店铺选购天然祖母绿，并认准权威证书。