玉髓颜色因含有不铜矿物质而有所不同，其中有微晶石英玉髓的变种，如夹层为直线的缟码瑙，含有氧化铁呈半透明橙红色的光玉髓，红棕色变种的红玉髓，以及内涵树枝或海藻形状物质的苔藓玛瑙，树枝玛瑙等，另外有着青苹果绿的绿玉髓也很受大家喜爱！古代学者常把玛瑙，玉髓称为"第三眼",据说可使人与通过的波动频率产生共鸣，增强原子的力量，使电子发生作用，因此对喜爱占星，研究灵术的人来说，是增强自己透视灵界能力的催化剂，这就说明了为何所谓的天珠都喜欢以玛瑙或玉髓来作为原始的材料。淡淡的粉紫玉髓，很少见，看了有说不出的舒服，颜色浪漫呈半透明状的紫玉髓是最近这几年才比较常出现在市面上的宝石，深浅不同的紫色很讨喜并且稀有，有关它的功能与紫晶有些相似，因为同样发出紫色光的关系。
据说玉髓可以减少眼睛方面的毛病，对于胆，肝，膀胱，骨头及血液循环系统也有帮助，另外还有可减少疼痛及促进孕妇哺乳的功效。古罗马人认为自己佩带玉髓可以化煞避邪，如果在紫外线UV光线或靛蓝色光照射下约30分钟就可以将玉髓的能量加强许多。
玉髓是月亮的代表，与水有密切的关系，因此据说可防溺水及意外发生、避免巫术的侵扰，对常常旅行在外的出外人来说，也是很好的护身符，可保平安并避免一些负面能量的侵害，对小孩也有避邪化煞的作用，蓝紫色的玉髓对应眉轮，可增加灵性及预知未来的能力。
