总的来说，水晶能够辅助治病大多数指的都是心理层面的。
对大多数人而言，身体这个名词代表的是实质存在的肉体；然而，对现代许多治疗者来说，他们却宁愿采取古代巫师的观念，认为人的身体除了可见的肉体之外，还包含了肉体周围不为人眼所见的微妙能量――他们称之为灵气、气场。不论是肉身体还是灵气体，只要其中任何一部分发生失调或失去连结，人就会感到不舒适。
人的许多疾病，其实就是身体处在一种不舒适的状态，它真正的原因可能是身体能量失调所致，而反应在肉体上，使身体挺直正常运作。
这种不舒适感也会展现在情绪上，当能量过多时，人就会感到愤怒，烦躁和失望；而当能量不足时，人就会变得抑郁或冷漠，如果是精神失去平衡，那么人就会出现像儿童一样的状况――自闭、阅读困难，或者出现一些成人的问题，像是压力、精神错乱或失意。
如果是心灵上的不适，那么它可能会从身体、情绪或精神等三个层面来显示它的症状，这时你的气场、派轮或肉体就会出现失衡的状况，而这些症状，都可以透过水晶治疗得到根本改善，水晶不只是治疗表面症状，而是内外的整合调整，让你的身心灵都达到真正的健康。
经科学研究发现，人体的脑部会放射出电波（脑电波），而水晶在特定状态下会产生压电性，其晶体（六方晶系）的六个点，以等轴异对角的位置带正电和负电的电荷，并释放出稳定的震荡频率，当人们对着水晶冥想时，也就是以集中的能量向它传送脑电波，水晶就会将这种能量储存、扩大，并协调周围的磁场，即所谓的水晶灵性。
现代人自少在情绪生活方面，经常患得患失，小小年纪已面对学业上的竞争；少年时代初尝人事，在感情世界上纠缠；出来社会做事，工作压力越大，代表自己越成功；似乎失眠、胃痛已成为天公地道的事。我们已忘记，原来身体的不适，反映出生命的危机及一个渴望舒适生活的内心世界的抗议。我们长年累月在痛苦中挣扎，习以为常，饮鸩止渴，还以为这是丰盛人生。
水晶治疗对纠正这方面的毛病特别有效，因为，水晶治疗的秘诀是，我们用自己的思想，结合水晶的能量，清除身体内的负性能量，令它回复正常。
水晶治疗对纠正这方面的毛病特别有效，因为，水晶治疗的秘诀是，我们用自己的思想，结合水晶的能量，清除身体内的负性能量，令它回复正常。
用水晶辅助治疗病症：
粉刺：紫水晶； 贫血：黄水晶、碧玺、红宝石、虎眼石； 心绞痛：祖母绿； 风湿性关节炎：紫水晶、玛瑙、黑碧玺、红玉髓、萤石、石榴石； 气喘：琥珀、紫水晶、粉晶、虎眼石； 背痛：黑曜石、孔雀石、蓝宝石； 净化血液：紫水晶、海蓝宝、石榴石、青金石； 平衡血压：紫龙晶、碧玺； 呼吸困难：琥珀、紫水晶、绿柱石； 支气管炎：发晶、软锰磷； 肺气肿：琥珀、紫水晶、粉晶、虎眼石、绿柱石； 眼睛发炎红肿：蓝纹玛瑙、蓝宝石、绿玉髓； 改善视力：海蓝宝、紫龙晶、红纹石、粉晶； 增加受孕率：红玉髓、绿玉髓、石榴石、粉晶、茶晶； 淋巴腺肿大：海蓝宝、蓝纹玛瑙、托帕石；
注意：以上所列举的一些水晶只适用于一般症状，若病症严重者，则应去医院请教医生并就诊，切勿盲目相信盲目适用。