天然水晶的天然指的并不是十全十美，反而越是完美的水晶越有可能是赝品，因此对于常见天然水晶的瑕疵的辨识对我们对天然水晶的鉴别以及欣赏都有一定的帮助。
常见瑕疵
1.冰裂纹：很多通透形的水晶，其内部常常会有些片状异物，给人一种花花的冰裂的感觉(有时还会有变彩效应)。据推测，应该是水晶在成长的过程中，遇到地震或是地层的挤压(地球内应力)而产生的一些“痕迹”(原子排列发生错位)，并不是裂痕。在粉晶、紫水晶、白水晶球、柱等体内都很常见。
2.棉或云雾：这也是对于通透形水晶而言的，就是其内部有雾蒙蒙的感觉，或是体内有棉絮状物质存在。钛晶、金发晶里面最多。通常佩带久了后，棉或雾会越来越少，什么道理，博主也是思考不透。
3.矿缺：主要是指水晶表面的坑洼，是水晶在成长过程中自然形成的而并非是人为造成的损伤。绿幽灵、钛晶、金发晶等晶体上都比较常见。
上述三种就是常见水晶瑕疵。其实还有一些其他，比如绿幽灵，50%绿色中带了一点红色颗粒。也算是瑕疵。可是也有红幽灵。所以说，需要具体看品相。有时候选择自己喜爱的才是最好的。一些云雾有可能更增添其美色。