1、真菌生命力极其顽强，许多灰指甲患者治疗一段时间认为灰指甲治好后就没再继续坚持用药了，实际上，灰指甲的真菌还是有一些没有杀灭干净，这小部分真菌一旦在条件适宜的情况会再次滋生发作，导致灰指甲久治不愈。因此，这是导致灰指甲的原因之一。
2、 灰指甲的真菌对药物的不敏感，处于休眠状态的灰指甲的病原真菌体对一般抗真菌药物根本无反映，而且真菌休眠的潜伏期较长。一旦用药停止，气温湿度等环境合适，真菌孢子便会萌发、生长、繁殖。所以，这也是属于诱发灰指甲的原因的因素。
3、因脚气真菌导致重复感染性，在大多数情况下，先因有了脚气而后继发灰指甲，也有一些病例是由于灰指甲以而导致脚气或手癣，这也是灰指甲的原因。