灰指甲的治疗主要靠抗真菌药物，由于口服抗真菌药物副作用大，目前一些外用抗真菌药物应运而生，并可获得较好的疗效。常用的有8%环吡酮甲涂剂，联苯苄唑甲药盒，5%阿莫罗芬甲涂剂。
1、8%环吡酮甲涂剂，商品名巴特芬。它是一种由德国赫司特公司研制开发的甲涂剂剂型。环吡酮对角质层有极佳的穿透性，在病甲板的外侧涂药后可以渗透到甲板内侧，而且涂药后像涂指甲油一样透明、亮泽、美化外观。它对大部分皮肤癣菌都有较好的杀灭效果。用法较简便，每周只需涂药1～2次，指甲病变连用4个月，趾甲病变连用6个月可获治愈。
2、联苯苄唑甲药盒，商品名美克药盒。它是由德国拜耳公司研制生产的剥甲加抗真菌杀菌药。它的药盒内有螺旋涂药器、刮甲器、防水胶布、每克含0.01克联苯苄唑和0.4克尿素的软膏。尿素有良好的剥甲效果，联苯苄唑有良好抑制杀灭真菌的效果。先用软膏涂抹在病甲上，连续封包1～2周，当病甲软化后用刮甲器刮掉已软化的甲板。然后外用1%联苯苄唑软膏每日涂1次，连用4周，或直到正常甲板完全长出为止。
3、5%阿莫罗芬甲涂剂，商品名为罗美乐，是由瑞士罗氏公司研制生产的抑制杀灭真菌的药物，其疗效好用法也很简单，每周涂药1～2次，连用6个月可获治愈。