潜伏梅毒曾被称做隐性梅毒，产生潜伏梅毒主要的原因是，梅毒未经治疗，或治疗药物剂量不足，治疗不彻底，表现为患者无临床症状，梅毒血清反应阳性。还有另一种情况，患者曾有过某种方式的感染途径，但由于患者抵抗力强，没有出现过或仅出现过非常不显著的临床症状如宫颈硬下疳，以后一直没有临床表现，但梅毒血清为阳性，这都是潜伏梅毒。其发生主要取决于机体本身的免疫力、治疗与梅毒螺旋体之间的较量的结果。
当机体免疫功能正常，或在治疗其他疾病时曾不正规地使用过与治疗梅毒有关的药物，产生了一定的治疗效果时，体内的梅毒螺旋体受到一定的限制；当机体在某阶段健康状况不佳、免疫功能降低时，梅毒螺旋体可乘机在人体内广泛活动并损害各种组织。当出现前一种情况时，即为潜伏梅毒，当出现后一种情况时，就为显发梅毒。潜伏梅毒的分期完全同显性梅毒，后天梅毒以2年为界，先天梅毒以2岁为界，均可分为早期和晚期。