台风灾害对海水鱼工厂化养殖的影响主要体现在：因狂风造成养殖设施受损及供电、供氧中断;短时间大量降水造成的倒灌和水源水质环境因子突变;外部交通不畅造成物资供应停滞等。
(一)台风前注意事项及防护措施
1.密切关注台风动态，提前做好防御安排
气象台根据台风可能产生的影响，在预报时采用“消息”“警报”和“紧急警报”三种形式向社会发布。同时，按台风可能造成的影响程度，由轻到重向社会发布蓝、黄、橙、红四色台风预警信号。海水鱼工厂化养殖从业者应密切关注台风预警动态，及时采取预防措施。
2.养殖车间设施检查、加固
(1)养殖车间门、窗应检查安装是否牢固，并在台风来临前关闭，玻璃窗可用胶带“米”字粘接，防止玻璃破碎后产生飞溅。
(2)检查养殖车间、温室屋顶是否有松动、破损;提前对养殖车间、温室屋顶进行压载或用大网目网片罩压，防止台风过大掀掉屋面。查看屋面集雨槽、屋面排水槽和落水管是否堵塞等问题，并及时加固、填补和疏通。
(3)检查养殖车间屋顶太阳能发电板、蓄热管等配套设施是否安装牢固，并及时加固。
(4)低洼地区应防止车间内积水，可在门口安放挡水板或堆砌沙包，封堵排水管沟，避免倒灌。
(5)全面检查电气设备接地、漏电保护、等电位联结等是否正常，提醒养殖工作人员可能造成的触电风险。
(6)饲料间、药品房、配电间、控制间等应能充分防水。
(7)检查场区排涝设施，确保排水沟和管道通畅，对于有大型蓄水池的养殖场，应提前减少存水量。
(8)室外车辆、动植物、工具、仪器设备等应提前转移至安全区域，避免倒塌、砸轧等情况发生。
(9)依据台风预报情况，对电线杆、室外电缆、摄像头等做适当的防护加固。
3.应急措施准备工作
(1)应急物品准备：包括雨伞、雨衣、手电筒、收音机、食物、饮用水、常用药品、防寒衣物等，预先购置排涝水泵等设施装备。
(2)检查应急备用发电机应能至少保证所有养殖池曝气风机正常工作，储油量应至少满足24h应急发电需求。
(3)检查液氧储罐，应至少满足24h应急使用需求;建议储备过碳酸钠(粒粒氧)应急备用。
(二)防灾期间的养殖生产管理
(1)适时减量投喂或停喂，避免台风长时间影响正常生产。
(2)应关注工厂化养殖用水的水温、盐度、pH变化，采取有效措施避免养殖生物应急。
(3)严禁人员在脚手架、电线杆、树木、广告牌等地方停留躲避。
(三)台风后防灾减灾要点与措施
1.及时查看水源、养殖车间、鱼池、设施设备等是否正常，及时排除现场存在的安全隐患，发现问题，尽快组织维修。
2.受淹车间应尽快疏通排水管道，排出积水。
3.清捞并记录死亡鱼的数量、规格，无害化清除并掩埋腐烂变质的死鱼，减轻对养殖环境的影响。
4.如灾害期间出现非正常养殖生产状态(停电、停气、停水、水质变差等)，需对养殖动物进行抗应激处理，并视情况对养殖动物及环境进行常规消毒处理，并根据摄食情况逐渐恢复正常投饲，合理安排后续养殖生产。
5.在做好以上工作的同时，积极做好风后持续大暴雨防范工作。
6.总结经验，吸取教训，对在台风中的损失做正确的估计，及时补充恢复必要的应急物资，强化下一步养殖工作注意事项。