在我国，脑CT较普及，一般的县级医院都有，检查方便且费用较低，可以用来粗略看一下脑内结构，清晰度不如脑磁共振检查。脑磁共振检查通常可以提供比脑CT更多的信息，是成像更清楚的一种检查
两者都是最常见的结构影像学检查，都是用来看脑结构的成像技术。在我国，脑CT较普及，一般的县级医院都有，检查方便且费用较低，可以用来粗略看一下脑内结构，清晰度不如脑磁共振检查。脑磁共振检查通常可以提供比脑CT更多的信息，是成像更清楚的一种检查，有些异常在CT上看不出来，但在磁共振上则能显示清楚，例如，局灶性脑皮质发育不良。检查费用高和普及程度低，是磁共振检查的缺点。