任何一种影像学检查手段，都有长处和短处，CT扫描也不例外，虽然全身各个部位都可以检查，但绝不是所有病变做CT扫描都能获得准确诊断，而有其相应的适应症。
一、颅内病变：颅内肿瘤、颅部外伤、脑血管病，脑变性疾病、先天性畸形、颅内感染性疾病、脑积水、代谢性疾病。
二、五官：眶内炎症、眼格氏病、眶内肿瘤、眼眶外伤及眶内异物；外耳、中耳、内耳先天性畸形、颞骨外伤、耳硬化症、中耳炎症、颈动脉球瘤；鼻窦炎、鼻窦囊肿及息肉，鼻窦及鼻咽部肿瘤、喉癌、涎腺肿瘤以及炎症。
三、颈部疾病：颈部肿瘤、甲状腺肿瘤、甲状腺弥漫性肿瘤、甲状旁腺肿瘤。
四、胸部：肺炎、肺结核、肺部肿瘤、结节病，胸部外伤，肺血管病，肺囊肿，肺隔离症。纵膈肿瘤，血管性病变及转移性病变，心包病变，胸腔积液，胸膜间皮瘤，胸膜转移瘤。
五、腹部：肝、胆、脾、肾、肾上腺、胰腺等器官的良性及恶性肿瘤，感染性疾病，肝局灶性增生，肝硬化，腹部外伤，胆道、泌尿系统结石，梗阻性黄疸的鉴别，胆总管囊肿、肝、脾、肾先天性病变，胃肠道肿瘤及肿瘤向周围侵犯范围及程度。
六、腹膜后病变：腹膜后肿瘤，腹膜后纤维化，腹主动脉瘤等。
七、盆腔：膀胱结石、膀胱肿瘤、前列腺增生及肿瘤，前列腺结石，子宫肌瘤，子宫癌，附件囊肿及肿瘤。
八、脊柱、四肢：脊柱、四肢外伤，骨折，椎管内有无骨折片，椎管有无变形、狭窄，脊柱，四肢炎症，结核，肿瘤，关节退行性病，椎间盘突出等。
九、特殊检查：颌面部骨折的三维重建，脑血管及主动脉血管的三维重建，肝脏三期扫描等。