骨科门诊中，有的患者因行动不便或是图省事，常要求做CT来替代普通X光片检查或者要求用磁共振(MRI)代替CT检查，认为磁共振(MRI)成像比CT 清楚，CT比X光检查清楚。要用MRI结果代替X线和CT，只要求做1次检查。这种观点是不正确的，三种检查手段是不能互换替代。
X线疾病初筛的首选检查X线检查费用低廉，适合多数患者常规检查，尤其是疾病初筛的首选检查方式。对于骨折移位、有骨质改变的骨病、关节部位骨性病变、不透光异物存留、心肺器质性疾病、消化系统梗阻等疾病有很好的诊断价值。
另外，X光片能发现患者在改变体位时才感觉到不适的疾病。尤其是动力位片检查，目前在国内尚极少能用磁共振替代X光检查的。
CT可显示出血管病变CT检查在显示横断面方面明显优于X光片，尤其是对密度高的组织显像清晰，对于测量骨性结构之间的距离精确度高。CT能清晰的显示血管走向及血管病变，对肿瘤的检查灵敏度明显高于普通X光片。而且，多排螺旋CT能进行三维成像，有助于立体显示组织和器官病变。但是，CT扫描限于技术员的专业水平不同及扫描层面间隔限制，不能整体的阅读检查部位的信息，导致有一定的漏诊率。另外，CT对软组织显像清晰度和分辨率不高。
MRI查软组织效果更好磁共振(MRI)与X光和CT检查最大的不同在于检查过程中没有X线辐射，对机体的损害很小。主要用于发现软组织疾病，在骨科主要用于发现椎间盘病变、脊髓病变、半月板病变、炎性病变和出血性病变等。通过不同的处理技术能早期发现松质骨骨折如椎体骨折、骨盆骨折;早期发现炎性疾病如股骨头无菌性坏死、骨结核、骨肿瘤等。MRI对血管方面的疾病灵敏度高。但是，MRI也是有缺点：一是普通MRI检查费用相对较昂贵;二是每个部位检查时间较长;三是对部分骨组织的显像精确度不如CT;而动态MRI费用是动态X光片的数10倍。
因此诊断中，脊柱骨折、脊柱滑脱、脊柱畸形、脊柱失稳等疾病首选X光片检查;判断是否为新鲜骨折时可以使用脱脂相MRI检查;在诊断椎间盘病变尤其是颈椎病的诊断时，首选MRI检查，在进行脊髓形态、脊髓畸形、脊柱肿瘤、脊柱结核等疾病检查时亦首选MRI。对于脊柱骨折、椎管病变、关节突关节病变诊断中，CT检查有着不可替代的优势。总之，三者是不可相互替代，不是越贵的检查越能发现问题，就诊时要遵从医生的检查要求，以便能尽早、准确的发现问题。