MRI诊断时应遵循的一般规律：
1．仔细观察各扫描方位，每个序列的每帧图像，如矢状位、冠状位、轴位等，以便获得病变的立体感，这是判断病变的起源及定位诊断的主要依据。
2．病变在每个序列中的信号强度和强化方式是定性诊断的关键，如肝癌表现为稍长Tl和稍长T2信号；肝血管瘤表现为稍长Tl和极长T2信号；肝囊肿表现为极长Tl和极长T2信号；某些病变如脂肪瘤的信号强度更具特征性，呈短Tl高信号，在脂肪抑制序列上其与脂肪信号同步降低。病变是否强化以及强化方式有重要诊断价值。一般认为，肿瘤性病变绝大多数有明显强化，而非肿瘤性病变一般不出现强化。又如，肝血管瘤增强后自周边呈向心性强化，直至充填整个病灶，这种强化方式是肝血管瘤的特征。
3．病变的大小、形态、数目、部位及其毗邻关系，有助于病变的定性诊断。一般来讲，恶性肿瘤易多发，形态不规则；良性肿瘤多单发，呈类圆形。某些病变有特定的发病部位，对定性诊断有帮助，如室管膜瘤易发生在脑室内，生殖细胞瘤多位于松果体区，颅咽管瘤多发生在鞍区。
4．一些特殊的MR检查如MR水成像、MRA、MRS、fMN等是定性诊断的重要补充，但往往需要结合常规MRI检查方能确诊，如胰头癌在MRCP上只能显示胆总管及主胰管梗阻的部位和程度，对癌瘤本身则无法显示；大面积脑梗死MRA只能观察到某支血管的闭塞，而无法显示梗塞的部位和范围。因此，MR特殊检查必须与常规MRI相结合，缺一不可。
对部分病变而言，MRI表现缺少特异性，定性诊断仍很困难，必须密切结合临床病史及相关实验室检查，如在MRI上发现两侧基底节区尤其是豆状核对称性信号异常，临床见到眼K—F环及血清铜蓝蛋白降低，则可确诊为肝豆状核变性。