一、对猪传染病出现的新情况（如隐性感染、潜伏期感等）认识不足，造成病原在人们的眼皮底下到处传播
二、引种混乱、检疫不严
由于引种部门和渠道众多、检疫手段落后和检疫不严致使引进的种猪不仅带入了新的传染病（如猪圆环病感染、兰耳病和猪传染性胸膜肺炎等），而且使全国各地原已基本控制了的传染病又重新复发，造成疫病的严重发生。
三、兽药、疫苗质量不稳定，使用不当
1.兽用疫苗和兽药生产质量难于保证。 2.疫苗和药品运输、保存、使用不当，易影响其免疫效果和治疗效果。 3.广大农村养猪专业户防疫意识淡薄，免疫密度不够，免疫程序不合理，致使猪群不能获得免疫保护，造成疫病的发生与流行。
四、生物安全措施不力
1.饲养规模和密度过大、通风换气不良 2.各种应激因素增多 3.粪尿和污水排放量过大、处理能力差 4. 生物安全意识缺乏，致使环境性病原菌广泛存在于饲养环境之中，通过各种途径进行传播。 5.盲目大量滥用抗菌药物，任意加大使用剂量 6.饲料中长期添加某些抗菌药物，使一些细菌和寄生虫产生耐药性。
五、诊断手段落后，不重视免疫监测
1.缺乏有病求医的思维。当猪场发生疫病时，不及时作出正确诊断，而是盲目用药。 2.缺乏定期进行免疫监测的思想意识。有些人根本就不知道有免疫监测一事。