2019冠状病毒病（COVID-19）的流行已经持续了两年之久。期间人们对COVID-19的流行方式，肺炎，急性呼吸衰竭综合症，肺栓塞，临床表现和治疗策略等进行了大量的研究。虽然在减少COVID-19的死亡率和发病率等方面已经取得很大的成就，但是在面临新近发现的COVID-19变异株上还存在诸多挑战。最近SARS-CoV-2进化技术咨询组发现奥密克戎（B.1.1.529）是严重急性呼吸综合症冠状病毒2（SARS-CoV-2）的变异株。世界卫生组织（WHO）宣布奥密克戎（B.1.1.529）为“须关切变种”。
2021年11月9日人们首次确定了奥密克戎（B.1.1.529）的存在，并于2021年11月24日从南非汇报给了WHO。病毒技术咨询组于2021年11月26日对其进行了评估。2021年11月27日在欧洲（例如英国，德国，比利时和意大利等国）也发现了奥密克戎（B.1.1.529）的存在。虽然在世界不同地区测序结果存在不一致性，但是据估计奥密克戎（B.1.1.529）已经在世界范围内有流行（例如香港和以色列）。我们希望目前的疫苗平台可以预防奥密克戎变异株的发生，或者减缓奥密克戎变异株迁徙的严重程度。继Delta变异株之后，人类可以对奥密克戎变异株有更好的了解，并对奥密克戎变异株的流行情况有更好的掌控。幸运的是截至目前南非只是在短时间内出现了三次发病高峰。虽然目前还不清楚奥密克戎和Delta在毒性和致命性等方面的差异情况以及目前有多少国家和人数感染了奥密克戎，但是有人认为奥密克戎是一种可以在世界范围内危机人生命的病毒变异株。有效的预防和治疗策略与奥密克戎病毒的变异监测系统敏感性，有效性以及人类相应的感染预防措施等因素紧密相关。
2021年11月30日，Clinical and Translational Medicine 期刊在线发表了上海复旦大学附属中山医院王向东教授和美国纽约CharlesA. Powell教授的最新社论 “ How to translate the knowledge of COVID-19 into theprevention of Omicron variants”[6] 。
文章概要
目前在预防和治疗奥密克戎变异株方面人类还面临许多不确定因素。例如人类怎样才能有效地保护自己不被奥密克戎变异株感染，是否目前现有的COVID-19疫苗对奥密克戎变异株也有效，是否戴口罩，洗手和社交距离对预防奥密克戎有效等。从目前的情况看这些措施可以有效地减缓奥密克戎的传播。因为奥密克戎变异株成员存在序列上的变异，而这种序列上的变异可以导致对人体体液和细胞免疫的逃逸，所以还不确定是否COVID-19疫苗可以有效地预防奥密克戎变异株的感染。奥密克戎的PCR测序不能检测到S基因丢弃和S基因靶标失效。这说明目前急需对奥密克戎的序列进行完整的解析。
目前的当务之急是定义奥密克戎变异株的序列和分子结构，并验证SARS-CoV-2PCR诊断的精确性。因为在世界范围内开展奥密克戎的检测是必要的，所以降低检测成本，选择最佳抗原检测位点就显得十分重要。目前疫苗是防止奥密克戎感染大流行的最有效措施之一。最近的数据表明疫苗和疫苗加强针对减少冠状病毒的病例数，住院数和死亡率都十分有效。大量的临床报道表明在中高风险地区和国家COVID-19疫苗可以防止SARS-CoV-2的感染。用疫苗的方式有效的预防奥密克戎和未来其它变异株的感染是一项长期且十分重要的工作。不能检测出S基因丢弃和S基因靶标失效（三种检测靶标基因之一）说明定义奥密克戎序列的紧迫性，这对有效检测出奥密克戎感染病例以及研发相应疫苗具有十分重要的意义。
人们在思考目前所有对COVID-19的了解可以在多大程度上帮助对奥密克戎变异株分子机制和发病机制的理解。例如针对COVID-19疾病严重程度分型的炎症模型和机器学习模型已经用于预测COVID-19重症病例发生的可能性。多临床中心关于系统性炎症的研究数据表明，目前已经可以在COVID-19病情恶化的前20天准确地预测到COVID-19病情恶化的发生。如果这项成果可以用于奥密克戎变异株的预测，那么临床治疗就有了方向，可以提早进行相应的预防和治疗措施。目前针对重症COVID-19患者有多种治疗措施，例如地塞米松，托珠单抗，康复期血浆，中药，人月经血来源的间充质细胞和一些新药。问题是怎样有效地用这些药物去治疗奥莫克戎变异株的感染。
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因为目前还没有对奥密克戎变异株进行系统性，动态性的病毒学和生物学研究，所以奥密克戎变异株相关的变异仍是一个极具挑战性的问题。从2021年11月9日奥密克戎变异株（B.1.1.529）首次被发现直到2021年11月30日，在30个国家和地区共有大约200名奥密克戎感染者被发现，同时还伴有数不清的接触者。人们还应注意奥密克戎与其它种类病毒，细菌（原发和继发感染）和其它种类病原体的关系。因为病毒的生存和传播与宿主密切相关，所以还需密切关注宿主免疫细胞的激活和耗竭。奥密克戎的毒性与2021年初α变异株毒性的比较情况还不是十分明确。
随着时间，人种，个体，治疗的不断进行，奥密克戎变异株的成员数量和突变位点等情况将会越来越复杂。人们需要密切监测奥密克戎感染患者的免疫状况，肺部疾病，发病分子机制（例如信号通路）等的变化。目前人们提出为了更好地了解患者对疾病的反应性以及循环免疫细胞的作用，可以把循环免疫细胞单细胞RNA测序作为临床的常规生化检测指标。如果这些数据可以在公共数据库得到分享，将极大促进人们对奥密克戎以及SARS-CoV-2各种变异株流行病学，公共卫生，诊断方法，免疫反应，中和抗体等各个方面的进展。
总之奥密克戎变异株是“须关注COVID-19变异株”的一员。此外在某些地区由于COVID-19变异株的出现或者宿主免疫缺陷的原因，可能会出现某COVID-19变异株在局部地区流行。因此要大力推进疫苗接种，加强和病毒检测，以便防止COVID-19的传播和快速蔓延。目前急需开展的工作包括奥密克戎的病毒学和生物学研究，临床表型的定义，治疗，基因组动态监测以及如何把现有对COVID-19的理解延伸到新的变异株。临床和转化医学的进展将极大促进这些问题的解决，以及对新变异株传播，疾病严重程度，免疫逃逸，诊断和治疗的理解。
参考文献
1.She J, Jiang J,Ye L,HuL, BaiC, SongY. 2019 novel coronavirus of pneumoniainWuhan, China: emerging attack and management strategies. Clin Transl Med.2020;9(1):19.
2.Li L, Huang Q, Wang DC, Ingbar DH, Wang X. Acute lung injury in patients withCOVID-19 infection. Clin Transl Med. 2020;10(1):20-27.
3.Poor HD, Ventetuolo CE, Tolbert T, et al. COVID-19 critical illnesspathophysiology driven by diffuse pulmonary thrombi and pulmonary endothelialdysfunction responsive to thrombolysis. Clin Transl Med. 2020 ; 10 (2) : e44.
4.Zhang L, Wang DC, Huang Q, Wang X. Significance of clinical phenomes ofpatients with COVID-19 infection: a learning from 3795 patients in 80 reports.Clin Transl Med. 2020;10(1):28-35.
5.WHO. Classification of Omicron (B.1.1.529): SARSCoV-2 variant ofconcernhttps://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern.
6.Wang X, Powell CA. How to translate the knowledge of COVID-19 into theprevention of Omicron variants. Clin Transl Med . 2021;11e680.