Nucleic,Acids,Res,|,浙江大学范衡宇团队发现早期胚胎发育过程中母体mRNA清除的新机制

胚胎从母体mRNA清除开始其生命,这对胚胎发育至关重要。然而,在早期哺乳动物胚胎中引发母体mRNA衰变的合子因素在很大程度上仍然未知。由于桑椹期早期发育停滞,小鼠中的Pabpn1基因敲除导致胚胎植入前死亡。

来源:iNature(ID:Plant_ihuman)

胚胎从母体 mRNA 清除开始其生命,这对胚胎发育至关重要。母体转录的消除是通过两种途径的联合作用发生的:母体编码的 mRNA 衰变途径 (M-decay) 和合子基因组激活 (ZGA) 依赖的途径 (Z-decay)。然而,在早期哺乳动物胚胎中引发母体 mRNA 衰变的合子因素在很大程度上仍然未知。

2021年12月14日,浙江大学范衡宇团队在Nucleic Acids Research(IF=17)在线发表题为“Nuclear poly(A) binding protein 1 (PABPN1) mediates zygotic genome activation-dependent maternal mRNA clearance during mouse early embryonic development”的研究论文,该研究将合子编码的核聚 (A) 结合蛋白 1 (PABPN1) 鉴定为母体 mRNA 转换所需的因子,具有以前未描述的细胞质功能。细胞质 PABPN1 停靠在末端尿苷酰转移酶 TUT4 和 TUT7 下游的 3'-尿苷化转录物上,并将 3'-5' 外切核糖核酸酶 DIS3L2 募集到其靶标,促进母体 mRNA 衰减。

由于桑椹期早期发育停滞,小鼠中的 Pabpn1 基因敲除导致胚胎植入前死亡。通过 Z 衰变途径消除的母体 mRNA 未能从 Pabpn1 耗尽的胚胎中去除。此外,PABPN1 介导的 Z-衰变对于主要的 ZGA 至关重要,并调节小鼠植入前胚胎中细胞命运决定因子的表达。这项研究揭示了 PABPN1 不可预见的细胞质功能与早期胚胎发育相结合,表征了母体 mRNA 合子不稳定因子的存在,并阐明了 Z 衰变过程机制,这可能有助于人类生育。

母体到合子转变 (MZT) 是所有动物的基础,通过两个阶段的组合发生,母体 RNA 和蛋白质的清除,然后是逐渐的合子基因组激活 (ZGA),在此期间蛋白质合成从母体转换胚胎细胞核合成的蛋白质的产物。引发这种转变的主要事件是消除母体以高度协调的方式赋予的大量 mRNA。这种降解在果蝇、斑马鱼和非洲爪蟾中得到了很好的表征,并通过两种连续活动实现:前者完全由母体提供的基因产物介导,称为 M-衰变;后者由新表达的合子产物执行,因此称为 Z-衰变。母体mRNA清除对于确定受精卵的发育能力至关重要,这种清除失败会导致不同物种的发育停滞。

Poly(A) 尾是大多数真核 mRNA 3' 末端的非模板化腺苷添加物,在 mRNA 稳定性中起关键作用。去腺苷酸化是 mRNA 降解过程中的限速步骤。最近的研究发现,母体 mRNA 转换所需的关键因素与哺乳动物的去腺苷酸化密切相关。CNOT6L 是 CCR4-NOT 去腺苷酸酶复合物的催化亚基,与 ZFP36L2 在卵母细胞成熟过程中介导母体 mRNA 衰变有关。已鉴定出一种卵母细胞特异性聚 (A) 结合蛋白核 1 样因子 (PABPN1L),以促进MZT 期间母体 mRNA 清除。所有这些因子都在卵母细胞中表达,并负责在 M 衰变期间母体 mRNA 的阶段特异性降解。

Z-衰变途径也在小鼠和人类母体 mRNA 降解分析中得到表征。母体沉积的 BTG4 和 CCR4-NOT 去腺苷酸酶复合物继续用于 Z 衰变,合子表达的 TUT4 和 TUT7 末端尿苷基转移酶催化去腺苷酸化后母体转录物的末端尿苷化,促进母体 mRNA 清除。然而,这些合子因子只占 Z 衰变过程的有限部分;其他 mRNA 去稳定剂和协调 3'-尿苷化步骤的途径仍然知之甚少。

示意图显示 PABPN1 作为介导 Z 衰减的合子因子(图源自Nucleic Acids Research

Poly(A) 和 oligo(U) 被认为是控制 mRNA 稳定性的拮抗剂。聚 (A) 尾部始终包覆有聚 (A) 结合蛋白,可稳定聚 (A) RNA 并促进翻译。反过来,oligo(U) 尾巴作为mRNA 衰变的一般标记出现,发生在无 PABP 的 mRNA 上。TUT4 和 TUT7 已被证明不仅可以靶向缺少 poly(A) 尾的 mRNA,还可以靶向具有短 poly(A) 尾(大约 < 25 nt)的 mRNA 。这些发现意味着存在着错综复杂的 mRNA 转换网络,但仍有待充分阐明。

在这项研究中,将 PABPN1 鉴定为介导小鼠 MZT 期间新细胞质途径中 Z-衰减的合子因子。由于受精后母体 mRNA 清除受损,Pabpn1 基因敲除小鼠胚胎在桑椹胚阶段是致死的。PABPN1 将 DIS3 像 3'-5' 外切糖核酸酶 2 (DIS3L2)(一种尿苷化 mRNA 的特定细胞质外切糖核酸酶)募集到 TUT4/7 介导的 3'-寡聚尿苷化转录物,以促进它们的衰变。这项研究揭示了 PABPN1 在早期胚胎发育进程中的一个以前未知的作用,并有助于阐明哺乳动物中母体 mRNA 衰变的过程。

参考消息:

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab1213/6460794

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