Science,Advances,|,诺奖获得者与西安交通大学刘青光团队联手合作,发现组蛋白瓜氨酸化在肿瘤生长和血管生成是必需的

缺氧诱导因子通过招募共激活因子和染色质修饰酶来激活靶基因的转录。肽基精氨酸脱亚胺酶4催化组蛋白精氨酸残基脱亚胺为瓜氨酸。缺氧诱导HRE处的组蛋白瓜氨酸化,这是PADI4和HIF依赖的。PADI4是小鼠乳腺和肝脏肿瘤生长和血管生成所必需的。肝癌也是高度缺氧的,四分之三的肿瘤检测的PO2为10mmHg或更低。PADI4表达增加在多种癌症类型中得到证实,包括乳腺癌和HCC。

来源:iNature(ID:Plant_ihuman)

缺氧诱导因子 (HIF) 通过招募共激活因子和染色质修饰酶来激活靶基因的转录。肽基精氨酸脱亚胺酶 4 (PADI4) 催化组蛋白精氨酸残基脱亚胺为瓜氨酸。

2021年8月27日,约翰霍普金斯大学Gregg L. Semenza(2019年诺贝尔生理学或医学奖获得者)及西安交通大学刘青光共同通讯在ScienceAdvances在线发表题为“Histone citrullination by PADI4 is required for HIF-dependent transcriptional responses to hypoxia and tumor vascularization”的研究论文,该研究证明PADI4 表达在乳腺癌和肝细胞癌细胞中以 HIF 依赖性方式诱导。PADI4 反过来被 HIF 募集到缺氧反应元件 (HRE),并且是 HIF 靶基因转录所必需的。

缺氧诱导 HRE 处的组蛋白瓜氨酸化,这是 PADI4 和 HIF 依赖的。RNA测序显示,乳腺癌细胞中几乎所有的HIF靶基因都依赖于PADI4。PADI4 是小鼠乳腺和肝脏肿瘤生长和血管生成所必需的。PADI4 表达与人乳腺癌活组织检查中的 HIF-1α 表达和血管化相关。因此,对缺氧的转录反应需要 HIF 依赖的 PADI4 募集到靶基因和局部组蛋白瓜氨酸化。

O2可用性降低(缺氧)是肿瘤微环境的一个特征。局部晚期乳腺癌中氧分压的测量结果显示,与正常乳腺组织相比,所有肿瘤区域的 PO2中位数为 10 mmHg(约 1.4%O2),其中四分之一的 PO2小于 2.5 mmHg。PO2的中位数为 65 mmHg(~9.3%O2),并且没有 PO2小于 15 mmHg 的区域 。肝癌也是高度缺氧的,四分之三的肿瘤检测的 PO2为 10 mmHg 或更低 。

瘤内缺氧是乳腺癌和肝癌进展的驱动力,由缺氧诱导因子 (HIF) 介导,HIF 是异二聚体蛋白质,由O2调节的 HIF-1α、HIF-2α 或 HIF- 3α 亚基和组成型表达的 HIF-1β 亚基组成。原发性肿瘤活检中 HIF-1α 表达增加与乳腺癌患者的无病、无进展和总生存期降低有关,并与淋巴结转移和肝细胞癌患者的总生存期降低有关。

为应对缺氧,HIF 激活数百个基因的转录,这些基因在血管生成、代谢重编程、细胞外基质重塑、侵袭和转移、癌症干细胞特化和免疫逃避中起关键作用 。HIF 激活转录的分子机制是一个活跃的研究领域。HIF 与包含核心 HIF 结合序列 5'-RCGTG-3'(R = A 或 G)的缺氧反应元件 (HRE) 结合并募集介质亚基、组蛋白修饰酶和染色质重塑复合物。正是通过募集这些蛋白质,HIF 和其他激活剂才能提高转录起始和延长的速率。HIF 还被证明可以调节编码共激活蛋白的基因的转录,然后 HIF 将其募集到靶基因。

众所周知,组蛋白尾部赖氨酸残基的乙酰化可减少其净正电荷,从而减少与带负电荷的 DNA 的相互作用,使 RNA 聚合酶 II 能够接近 DNA 并将其转录为 mRNA。此外,bromodomain蛋白与具有乙酰化赖氨酸残基的组蛋白特异性结合。一种鲜为人知的降低其净正电荷的组蛋白翻译后修饰是精氨酸 (Arg) 残基水解为瓜氨酸 (Cit),其由肽基精氨酸脱亚胺酶 PADI2和 PADI4催化。PADI4 将组蛋白 H4 的 Arg-3 水解为 Cit,并催化 H3 的 Arg 残基 2、8、17 和 26 ,H2A的Arg-3和 H1 的 Arg-54 脱亚胺化(瓜氨酸化)。除了影响组蛋白-DNA 相互作用外,瓜氨酸化还可能影响组蛋白-组蛋白相互作用以及组蛋白与其他染色质蛋白的相互作用。

PADI4 表达增加在多种癌症类型中得到证实,包括乳腺癌和 HCC。用泛 PADI 抑制剂 Cl-脒治疗会损害乳腺肿瘤异种移植物的生长。PADI 表达在暴露于缺氧或 HIF 诱导剂二甲基草酰甘氨酸的人神经胶质瘤细胞中被诱导。在食管癌细胞系中强制 PADI4 过表达刺激了肿瘤异种移植物的生长并增加了 CA9 的表达。该研究证明PADI4 表达在乳腺癌和肝细胞癌细胞中以 HIF 依赖性方式诱导。PADI4 反过来被 HIF 募集到缺氧反应元件 (HRE),并且是 HIF 靶基因转录所必需的。

缺氧诱导 HRE 处的组蛋白瓜氨酸化,这是 PADI4 和 HIF 依赖的。RNA测序显示,乳腺癌细胞中几乎所有的HIF靶基因都依赖于PADI4。PADI4 是小鼠乳腺和肝脏肿瘤生长和血管生成所必需的。PADI4 表达与人乳腺癌活组织检查中的 HIF-1α 表达和血管化相关。因此,对缺氧的转录反应需要 HIF 依赖的 PADI4 募集到靶基因和局部组蛋白瓜氨酸化。

参考消息:

http://advances.sciencemag.org/content/7/35/eabe3771

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