导致视神经萎缩的原因有4个：
1、外伤
视神经的直接损伤，如视神经的挫伤或撕脱。
2、细菌
葡萄球菌，肺炎球菌，脑炎球菌，布鲁杆菌及分枝杆菌均可引起视神经感染，通过特殊染色可以证实。视神经组织损害和反应性结缔组织增殖程度，与细菌和炎症强度有关，由于细菌和炎症导致视神经炎，后期会导致视神经萎缩。
3、病毒
病毒很少单独感染视神经，常产生无菌性脑膜脑炎。视神经和视网膜可发生急性病毒感染，持续性病毒（如：亚急性硬化性全脑炎），及慢性病毒感染（如：kuru病）。带状疱疹病毒，流行性感冒及牛痘病毒均可能引起视神经炎，后期导致视神经萎缩。
4、真菌
由于全身病或经免疫制苭治疗致免疫功能低下的病人对继发感染敏感，尤其是霉菌。糖尿病病人血糖控制差或发生酸中毒者易感染藻菌，这种藻菌可通过被感染的副鼻窦入视神经，好侵犯血管腔血管阻塞而发生缺血性视神经病变，最后导致缺血性视神经萎缩。