蟒蛇的免疫系统
野生蟒蛇比其它的爬虫动物更容易因人工饲养所产生强烈的反应。这种神秘而温驯的蛇似乎比其它物种更容易对人工饲产生不适。影响荷尔蒙分泌，这会牵连到正常的生理机能与行为。在被影响到的生理机能中，最重要的可能就是免疫系统了。现今的兽医知识很着重于支持蟒蛇的免疫系统，一方面避免疾病的发生，另一方面强化治疗效果。
寄生虫
想要您的蛇活的健康长久，将这些寄生虫消灭是非常重要的。
用镊子去除蛇螨后对资伤口要施以抗生素药膏，每天一次至少一周。因为蛇螨会在吸血时传染细菌性疾病，有系统的抗生素治疗常是必需的。
蛇螨可用除螨喷剂(含敌敌畏)、爱灭虫喷剂或除虫菊剂。可以把除螨喷剂放入小瓶子中(在盖子上打洞)，置入蛇箱中三到四个小时，每周二至三次，持续三周。当数量较大时，视清况每四到五天在蛇箱内及蛇的身上均匀的喷上一层爱灭虫(10毫克对945毫升的水)。我虽然不会对于内部线虫类的问题使用爱灭虫，但是爱灭虫在这种浓度下还没有产生过问题。
将蛇的水盆取出，直到药完全干掉再放回。只在通风良好的蛇箱中使用爱灭虫。我使用以下的方法有良好的功效: 对受感染的蛇及蛇箱内喷洒爱灭虫，于其它的地方如蛇箱外部及架子上喷洒除虫菊剂。您也可以在蛇箱外部使用爱灭虫，但它的药力能持续多久是未知的。在使用任何这些方式前，彻底的清洗蛇箱并将所有无法清洗的躲藏物丢弃。否则这些疗法都是无效的。
肠胃问题
许多人会发现他们刚买回的蟒蛇会吐、分泌过多的粘液、粪便带血或恶臭。肠胃炎通常是因为内部寄生虫、原虫、细菌感染或不当的照顾所引起。内部寄生虫及原虫可以藉由粪便检验发现，并且只要正确的用药，都可以轻易的治疗。不当的加温会导致免易力下降并且使肠道内的食物无法正常消化。喂食后两到三天内过度的把玩可能造成紧张的蟒蛇呕吐。
细菌感染也是常见的，或许因为虚弱的寄主会给细菌机会快速增生。要维持肠道内正确的细菌平衡，蟒蛇需要正常的进食与排泄。多数进口的蟒蛇都营养不良且脱水，这会加重影响它们肠道内的细菌平衡，造成其它细菌的增生。这些蛇通常也和许多其它的蛇混在一起，于是接处到其它传染性寄生虫、细菌甚至病毒病原体。对于轻微的症状，可以在第一、三天或单次给于口服甲硝唑(每公斤25~40毫克)。甲硝唑通常每当作杀原虫药，但它也是一种很好的肠道抗生素，对于不易辨别的厌氧性细菌特别有用。较难医治的案例，兽医可能要进行细菌培养来给于正确有效的抗生素。
在面对吐及腹泻的问题是，治疗期间暂停喂食让肠道有时间复原是很重要的。除非也会造成呕吐，应进行输液治疗。如果蟒蛇对治疗反应良好，初期可进行少量且少次的喂食。对体重小于1公斤的蟒蛇，这是每7至10天喂食一只乳鼠或很小的小白鼠。如果蟒蛇进食及排泄都正常，用二至三周将进食的量及频率调整到正常。虽然蟒蛇看起来不易过度进食，但喂食频率太高会造成消化不良及肠胃不适。