蛇毒的质量控制主要抓住三个环节：第一取毒，第二干燥，第三保管。三个环节都必须严格把关才能保证蛇毒质量的纯正。
(―)取毒
取毒用具必须专一品种专用，不得混用或者交叉使用；取毒时每次只能取一个品种，发现毒液有污染应立即清除，不能把血液、口腔粘液、脓汁或泥沙混入蛇毒；取毒现场应有冰箱或冰桶，取到一定量时应放入暂存。
(二）干燥
要求鲜毒尽快地脱水干燥，特别是常温干燥，应尽量缩短干燥时间。其方法是每次干燥的数量不能太多，干燥剂充足，在每次添加干燥剂时应该把蛇毒拿开，避免污染蛇毒。干燥后应该立即封装或到一定数量时再重新干燥4h〜6h后再封装。不同蛇种蛇毒不能同时干燥。
(三）保管
蛇毒质量的好坏与保管有直接关系。蛇毒干燥后吸水性很强，且不耐热，在潮湿高温时或有阳光直接照射下均可逐渐分解变质失效。因此要求保管时注意干燥、避光、低温、密封几个方面。
将干燥的蛇毒称重后尽快地装入棕色瓶内，瓶口用软木塞塞紧，然后用蜡封，外边盖上外套盖。亦可用磨口瓶蜡封，如数量较少可用大试管火熔封口，但不能装得过满。要求容器必须干燥、洁净，经高压消毒更好。封好后标记蛇种、产地、采毒日期、封装日期或批号。
封装好的蛇毒可放在阴凉处或冰箱内保管，一般可保存10年以上。切忌置于阳光下或接近温度超过30°C的地方，如暖气或火炉附近。
保管的蛇毒如果数量、品种较多时应建立档案，标记清楚，专人保管，严格交接手续，按国家毒品管理规定执行，不得随意拿取，以免混放影响质量或发生意外。
启封后的蛇毒如能在短期内用完不必再封，但应盖好放于暗处或冰箱内，亦可用黑纸包好放在干燥器内。为了启封后能尽快用完，每个包装不宜过大，一般20g、50g或l00g为好，取用方便，数量清楚。