蛇身体细长，呈柱状，皮肤干燥，缺乏腺体。皮肤上覆盖着鳞片，用以防止体内水分的蒸发。蛇类在生长过程中随着年龄的增长，会定期更换皮肤的角质层，这种现象称作蜕皮。蜕皮的次数与生长速度有关，快速生长的蛇每两个月可蜕皮一次，蜕下的透明角质层叫蛇蜕，有药用价值。
蛇的身体分为头、躯干、尾等部分。
(一）头部
头较扁平，呈椭圆形或三角形。口位于头的最前端（图2-1);口的上方有一对鼻孔，主要是呼吸门户，无嗅觉作用，蛇的嗅觉器官由口腔内的锄鼻器和舌头组成；鼻后有一对眼，无眼睑，视觉不发达，只在近距离能感知运动着的物体；蛇类没有外耳、中耳的鼓膜及鼓室，故不能感知空气中图2-1蛇的头部声波的刺激，声波沿地面通过位于头后方的一块方骨的振动传导给听骨（耳柱首）而产生听觉，故蛇类常以头部触及地面而盘伏。
有的种类如蝮蛇科的蛇，具有热能感受器，在结构上叫颊窝。颊窝位于鼻与眼之间的颊部，呈漏斗状，能感知辐射能极微弱的变化，对环境温度小到0.02°C的变化均能测出，并作出迅速反应。在蜕皮前，眼睛看不见，通过这种感觉也能准确地测到热的或冷的猎物（如老鼠）的确切位置，并将它咬杀而食之。
(二）躯干部及尾部
躯干部呈圆筒形，腹面末端有一泄殖孔（排泄和生殖共同开口），它是躯干和尾的分界。
蛇类没有附肢，有一些种类（如蟒蛇）泄殖孔两侧各有一呈爪状的后肢残余，雄性更为明显（图2-2)。蛇的运动靠肌肉牵引数量甚多的椎骨和肋骨，以及宽大的腹鳞来完成。