1.检验
血、尿、便常规，嗜酸性细胞计数，检测血沉、类风湿因子、蛋白电泳、免疫球蛋白、补体、循环免疫复合物、C反应蛋白、抗SS-A(Ro)、SS-B(La)抗体、抗平滑肌抗体、肝肾功能和HBsAg检查。测定抗嗜中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)，对诊断和监测韦格纳肉芽肿活动性具有重要意义。
2.X线胸片、肺功能及心电图检查
上呼吸道或支气管粘膜、肾脏活组织检查。
3.诊断标准
①鼻或口腔痛性或无痛性溃疡、脓性或血性鼻腔分泌物；②胸片示肺有结节、固定浸润灶或空洞；③尿沉渣镜检红细胞＞5个／高倍视野或出现红细胞管型；④病理检查示动脉壁、动脉及小动脉周围或外部区域有肉芽肿性炎症。具备以上2项或2项以上标准，可诊断为韦格纳肉芽肿。