手术方式有两种，二是切除患侧输卵管，即根治性手术，可经剖腹或腹腔镜下手术： 一是保留患侧输卵管手术，即保守性手术。
1．输卵管切除术：输卵管妊娠若已生育者，一般采用输卵管切除术，尤其适用于内 出血并发休克的急症患者。病情较缓或有条件者，可作腹腔镜手术，并根据对侧输卵管的情况结合患者有无生育要求酌情处理。
输卵管间质部妊娠，应争取在破裂前手术，以避免可能威胁生命的出血。手术应作子 宫角部楔形切除及患侧输卵管切除，必要时切除子宫。需保留生育功能者可切除患处后将输卵管移植于宫角处。若遇间质部妊娠破裂，应尽快手术抢救，常是在抗休克的同时进行手术，先钳夹骨盆漏斗韧带及子宫角部止血，切除间质部妊娠，应注意充分止血、缝合。不留缝隙。
2．输卵管保守性手术(保留输卵管手术)：适用于有生育要求的年轻妇女，特别是对侧输卵管有明显病变者。应根据受精卵着床部位及输卵管病变情况选择术式，若为伞部妊娠可行挤压术；壶腹部妊娠行输卵管切开取胚术；峡部妊娠行病变节段切除及端端吻合术。若采用显微外科技术可提高术后妊娠率。保守性手术除开腹进行外，尚可经腹腔镜检查。