薄荷病虫害主要有锈病、班枯病、小地老虎和银纹夜蛾等。
1、薄荷锈病。危害叶和茎。在5月～6月连续阴雨或过于干旱时易发病。开始在叶背出现橙黄色、粉状的夏孢子堆，后期发生黑褐色、粉状的冬孢子堆。发病严重时，叶片枯萎脱落，以致全株枯死。发病初期用20 ％三唑酮乳油1000倍～1500倍液或用敌锈钠300倍液防治。
2、薄荷斑枯病。又称白星病，危害叶部。5月～10月间发生。叶部病班小圆形，暗绿色，以后逐步扩大变为暗褐色，中心灰白色，呈白星状，上生黑色小点，逐渐枯萎、脱落。发病初期及时摘除烧毁。可用70％代森锰锌、75％百菌清500倍～700倍液喷洒。收获前20天停止用药。
3、小地老虎。危害幼苗，春季幼虫咬食苗茎，造成缺苗。40％菊马乳油、菊杀乳油2000倍～3000倍液喷洒根际，或用40 ％甲基异硫磷 1000倍液灌根。
4、银纹夜蛾。危害叶和花蕾，以幼虫咬食叶片，造成孔洞缺刻。用50％抑太保乳油每亩30毫升～60毫升兑水喷洒或用50％杀螟松1000 倍液喷治。收割前20天停止用药。